He encontrado un pequeño manual de R para principiantes.
Contiene también una introducción a la elaboración de gráficos con esta herramienta y algunos ejemplos al respecto.
Añado un ejemplo “for dummies”:
t<-read.table(”file.dat” #Lee el archivo y lo mete en una tabla.

postscript(”grafica.eps”, onefile=FALSE, horizontal=FALSE, height=8, width=8, pointsize=16)
#Hace que la salida se genere en el archivo grafica.eps
matplot(log(t[1]),t[2:4], type=”l” , col=c(1,1,1), xlab=expression(log[2](población)),ylab=”Building [...]

Como el Texmaker me da algunos problemas he decidido buscar algunas alternativas para trabajar con Latex, y he encontrado un par de plug-ins para eclipse:
http://texlipse.sourceforge.net/
http://sourceforge.net/projects/eclipse-latex